首先，美国、欧盟、日本等发达国家在涉及农业、反倾销等一系列问题上分歧严重，各方都不愿作出让步。例如，美国作为农产品出口大国，主张大幅度削减农业关税。而欧盟为了保护其成员国农民的利益，一直实行较高的农业补贴。双方在会议内部磋商中交锋激烈，结果不欢而散。
其次，发展中国家与以美国为首的发达国家在劳工标准等问题上矛盾难以调和。在内部磋商中，20多个发展中国家坚决反对美国有关建立劳工问题工作组的建议。可是，美国政府在国内劳工和人权组织的压力下，不愿在这一问题上作出任何让步。
再者，美国国内的政治气氛在一定程度上减弱了克林顿政府的谈判能力，使其无法在一些重大问题上作出妥协。明年是美国大选年，克林顿政府出于政治考虑和争夺选民的需要，不得不在一些国内政治敏感问题上采取强硬态度。
最后，世贸组织成员众多，各成员的文化背景、经济发展阶段、贸易谈判重点有着不小的差异，再加上该组织实行“协商一致”的决策机制，这就使得关于多边贸易谈判的磋商非常复杂和艰难。
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